首先以三维3配位sp2型共价键的单质碳晶体结构为例。根据石墨烯的结构特征,其中每一个碳原子喜欢形成3配位正三角形构型,其中键长键角分别是1.426 Å和120°;因此,我们需要可以写出的输入文件para.ini内容为(注释符#后为说明):
RANDMOD=0 #随机模式。
GID=75-230 #选择75到230号空间群
LCPARA= 3-12 3-12 3-12 30-150 30-150 30-150 #晶格参数随机范围
AELE= 6 #只有一种元素:碳
AELENUM= 1-6 #
1至6个非等价碳原子
ADDBONDLIST
6 6 6 6 #每个碳与另外4个碳成键
BONDANG[6]=120
#sp3型共价键键角为109°
BONDLEN[6][6]=1.46
#碳碳键长约为1.54 Å。
BONDLENTOLER=0.12
#可选,键长平均容差。
BONDLENERRMAX=0.2
#可选,键长最大容差。
BONDANGTOLER=0.15
#可选,键角平均容差
BONDANGERRMAX=0.22 #可选,键角最大容差
ATOMNUM=4-500 #可选,晶胞中原子数范围
BONDRINGMIN=5 #可选,最小环为5,排除4及3环等导致角度偏差过大的情况
注意,其中有些参数是可选的,去掉也可以正常运行。可选参数的目的是提高搜索速度或减少输出结果中不理想的结构等,可以根据实际情况选择使用或修改。